Stephylococcus

Tjoho!! Denna vecka har jag fått börja lära mig några nya avdelningar, sånt är alltid lika skoj och utvecklande :D De avdelningar som jag nu lär upp mig på är svalg, nasopharynx samt gonokockerna. Visst bakterierna ser ju likadana ut oavsett vilken avdelning du sitter på så det svåraste (som jag tycker) är att lära mig hur normalfloran ser ut i dessa lokalisationer och att på så vis kunna identifiera de patogena bakterierna. Man måste verkligen vara duktig på att särskilja mellan exempelvis alfa-streptokocker samt pneumokocker. En bakterier som man hittar mycket utav är Haemophilus sp så förhoppningsvis så kommer jag att lära mig den bakterien nu. Visst, jag har väl alltid förstått hur den ser ut i koloniutseende men det är just själva tolkning av resistensbestämningen som är så svårt med den bakterien. Så jag lär mig ju den aldrig :( Men någon bakterie måste man ju ha svårt för :)

 

Annars är det mesta sig likt på jobbet. Inte mycket nytt som händer. Fick vara med om ett möte om blododlingar med infektionsläkarna igår, så det var ju intressant att få höra deras synvinkel på det hela. Och imorgon ska jag få gå med på en revision av ett gonokockprov. Så då får vi se om man förstår något utav det :S

 

Tjoho alla glada bakterievänner därute :D Nu var det ett tag sen jag skrev här sist men har flängt runt lite på olika kurser och sånt så har inte riktigt haft tid. Har bland annat varit på ett trevligt nätverksträff med andra MALDI-intresserade på smittskyddsinstitutet där det snackades om MALDI i lite olika aspekter. Bland annat hur man kan snabbt identifiera bakterier som växer i blododlingar och på så sätt snabbt få ut ett svar på en artnamn på bakterien. Detta kan hjälpa klinikern att snabbt få fram ett lite smalare antibiotika fast man kanske inte riktigt har fått fram en resistensbestämning. Här ligger labben i Karlskrona (som jag har haft äran att jobba mina sex första månader som BMA) och Växjö i framkant. Inspirerande att höra om deras snabba diagnostik. Förutom att hänga med andra BMA på MALDI-mötet så har jag även varit på labombudsträffen som Riksföreningen för mikrobiologi anordnar. Ett trevligt möte där nästan alla mikrobiologiska lab var representerade. Där diskutera vi olika snabb tester, så kallade egentester, som bland annat apoteket säljer. Det mesta av dessa tester är ren skit, så tänk efter före innan ni köper dessa tester. Man kan tro att eftersom apoteket ska vara ett seriöst företag att de bara säljer bra och tillförlitliga tester, men det gör de asså inte!!! Vi hade även olika företag representerade som presenterade olika produkter. En annan sak som vi diskutera är även hur vi ska värva medlemmar till riksföreningen för mikrobiologi så därför gör jag reklam för dem ;) Personligen hade jag aldrig hört talas om dem länge så misstänker att många inte känner till föreningen. Men den är till för alla som gillar och diggar mikrobiologi :)

 

Nej, sen är det väl som vanligt på själva labbet. För tillfäller har vi massa studenter som ska praktisera hos oss och provsättningsroboten bara tuffar och går ;) Så det går bra nu :D

En otroligt cool cirkel! Någon därute som vet hur dessa uppkommer?

 

Jaha, nu har man redan jobbat över en vecka efter semestern och man börjar väl komma igång lite nu. Denna vecka härjar jag runt på såravdelningen, vilket är kul då det var typ ett år sen jag var där sist. När man är där blir man något av ett proffs på Staphylococcus sp eftersom de typ växer i vartenda prov!!! Jaja men det var inte det jag skulle prata om. Idag hade jag tänkt berätta om en fantastisk överlevnadsmekanism som enbart två bakterier nyttjar sig utav. Dessa två bakterier har gemensamt att de båda är grampositiva stavar. Men där tar väl de flesta likheter slut, den ena är nämligen strikt aerob medans den andra är strikt anerob. Ja nu kanske några utav er har kommit på vilka bakterier jag pratar om :) Till er andra kan jag avslöja att jag pratar om Bacillus och Clostridium. Vad består då deras fantastiska överlevnadsmekanism utav då? Jo de kan producera endosporer! Dessa endosporer bildas av en enda bakterie cell (detta kallas för vegetative cell) och en bakteriecell ger upphov till endast en endospor. Denna endospor gror (germinerar) sedan till en enda bakteriecell. Så som ni säkert kan lista ut så kan inte endosporer reproduceras. Beroende på vilken bakterie som bildar endosporena så får dessa olika positioner på cellen. Detta är mycket användbart vid identifiering av bakterien. Endosporerna kan antingen bildas centralt (som Bacillus cereus), subterminalt(=nära ena änden, Bacillus subtilis) och terminalt(=i ena änden, Clostridium tetani). Ibland kan dock endosporen bli så stor så den till och med sväller den vegetativa cellen.

 

Varför är endosporer så viktiga för bakterien då? Varför beslutar sig bakterien att lämna sitt stadie där den kan reproduceras mot detta viloläge? Är detta verkligen gynnsamt för bakterien? Ja det är det då endosporerna skyddar bakterien mot fientlig samt ogästvänliga miljöer. Detta kan exempelvis ske då ett viktigt näringsämne tar slut (som kol eller kväve). Att bilda en endospor tar relativt lång tid - i en bakteries värld iallafall - då denna process tar 8-10 timmar. Under denna process bildas ett tjockt lager av peptidoglykan samt en sporkappa runt en kopia av bakteriens DNA. Även lite cytoplasma bildas. Endosporen lagrar även stora mängder av dipikolinsyra, kalcium och DNA-bindande proteiner medan den gör av sig med det mesta av sitt vatten.

 

När bakterien väl har bildat sin endospor så är denna extremt tålig för uttorkning, värme, strålning samt dödliga kemikalier. Endosporer tål det mesta som normalt skulle döda den vegetativa cellen. Som exempel kan nämnas att en endospor håller sig levande i kokande vatten i flera timmar!! Just denna egenskap vållar stora problem i livsmedelsindustrin då dessa tål behandlingar som bakterier normalt inte klarar av. Endosporerna tillverkar även ett värmestabilt toxin som kan ge upphov till stelkramp, mjältbrand samt gangrän. (Ät därför inte ris som stått framme i rumstemperatur då ris innehåller endosporer. Dessa kommer sedan att germinerar när riset svalnar. Ett litet tips från mig bara ;)) En endospor kan även tolerera strålning som är mer än 4 gånger så stor än vad en människa skulle kunna överleva. Detta är ju en helt fantastik överlevnadsmekanism, eller vad säger ni? :) 

 

Så en endospor är ett viloläge för bakterien då den knappt metaboliserar något men när väl miljön runt omkring blir gynnsamt igen (exempelvis vid ökad näringstillgång) så germinerar endosporen till en vegetativ cell. Fantastiskt eller hur :) :D

 

 

Hej alla bakteriefreaks därute!!! Härligt att se att ni fortfarande tittar in på min blogg trots sommaruppehållet - ett tydligt tecken på att ni vill höra mer om våra underbara vänner bakterierna :D Ja, som sagt så är min semester slut nu så denna vecka har jag härjt runt på blodavdelningen och gramfärgat och hållt på. Än så länge ar jag inte stött på någon spännande bakterie, men de kommer väl :D Idag tänkte jag lite kort berätta om vad man egentligen gör på blodavdelningen och hur arbetsflödet går till.

 

Ja först så börjas det med att man får en remiss och,vanligtvis till det, fyra blododlingsflaskor. Två aeroba blododlingsflaskor och två stycken anaeroba blododlingsflaskor.

 

Dessa flaskor märks in och sätts in i ett blododlingsskåp - här i Borås används BacT/AlerT. Detta skåp håller en temperatur på 37 grader, allt för att gynna bakteriernas tillväxt. Flaskorna innehåller även kol eller gelkulor som ska neutralisera antibiotika om patienten har fått detta innan odlingen togs. Som ni vet dödar ju antibiotika bakterierna och det vill man ju inte ska hända i detta fallet!!! Om det finns bakterier produceras det koldioxid i flaskorna som detekteras av blododlingsskåpet och skåpet påvisar detta genom att larma - en flaska har blivit positiv. Denna flaska tas ut och odlas ut på en blod-, choklad- samt anaerobplatta. Även en bloddroppe strycks på ett objektsglas som därefter får torka. Detta objektsglas bränns av för att bakterierna ska fixeras - detta behövs för gramfärgningen. Med hjälp av gramfärgningen så får man veta om det är en grampositiv (blir blåfärgad) eller gramnegativ (blir rödfärgad) bakterie. Man får även reda på bakteriens form, om det är en kock eller en stav!!! Detta tycker jag är ett jättespännande steg, att man så snabbt kan veta vad som växer i blodet!!! :) Detta fynd svaras ut till avdelningen där patienten ligger och då passar man samtidigt på att fråga om patienten får något antibiotika - allt för att man ska kunna ge ett så bra svar så fort som möjligt! Ja sen gör man efterarbete på sin bakterie, lite olika beroende på om det var en grampositiv eller gramnegativ bakterie.

 

Detta gör man exempelvis på en gramnegativ bakterie. En jäsning innehållandes ett SIM (Svavelväteproduktion, Indol, Motilitet=rörlighet), urea samt ONPG-rör.

 

Tjo! Ville bara meddela att nu i semestertider så uppdateras inte bloggen! Så ha en trevlig sommar alla :D 

 

Tjoho alla bakteriefreaks! Jag vet att jag har varit gött kass på att uppdatera på senare tid. Sorry för det! Idag har det varit en lugn dag på jobbet, enbart tre positiva blododlingar! Men det kan man få vara värd när man har jobbat hela helgen :) Dock blev jag lite orolig av den sista bldodlingen som larma. En aerob flaska som larma efter tre dagar. Svårt att se något i prepet och det jag såg tyckte ja såg ut som konstiga små gramnegtiva stavar.... Man kan ju inte låta bli att tänka på Brucella (lång inkubationstid, växt i aerob-flaska samt små), jobbade ju med en för typ åtta månader sen... Men blododlingen var från en canerpatient så jag hoppas på att det var därför bakterierna såg lite påverkade ut. Lär väl märkas :D

 

Morgondagen ser jag framemot, då ska jag till Göteborg för att gå en kurs om Bact/ALERT (blododlingsskåp). Då ska jag förhoppningsvis lära mig mer om hur man hanterar olika fel och så. Kan bli kul, förberedde mig lite idag genom att läsa på om blododlingsflaskorna!

 

Nej det får bli allt för idag! Ha det bra i värmen därute:)

 

Hallo alla bakteriefreaks därute!!! Först vill jag passa på och tacka alla som har svarat på Sandras fråga. Härligt att se att de flesta är nöjda med sitt yrkesval. Personligen är jag mycket nöjd över att få jobba med mina fantatiska bakterier :) Och som många utav er skriver så är det upp till en själv hur mycket man utvecklas på sin arbetsplats! Så det är bara att visa framfötterna, tror mig ingen annan kommer att göra det åt en!

 

Annars så är det sig det mesta likt ute på labbet. Vi jobbar för fullt med att lära oss våran nya provsättningsrobot och det går framåt :) Nu sätter vi alla prover som går att sättas på maskinen och det blir verkligen fina utstryck som roboten gör. Bakteriekolonierna ses en och en och det gör det även fast det växer mycket i proverna!! Och det är just de enskilda kolonierna som är det bästa ju!! :D Men ibland så kommer de ju en Proteus som förstör det mesta av provet och ja, jag vet inte hur många gånger jag har suckat över det. Dock svärmar de ju fint, alltid något positivt ju! :D

 

 

 

 

 

Ja förra vecka så höll jag på att bli galen på våran VITEK MS (ja som Biomerieux kallar den, vi är ju en av få lab som har just den modellen på MALDI-TOFen). Den ville inte ge ett enda godkänt resultat. AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA är det man känner då! Men efter 4(!) dagar fungerade den igen och det visade sig vara fel på en kalibrering. Men nu funkar det felfritt igen! Och denna veckan ska jag utbildas i SARAMIS som är typ en forskardatabas som inte är godkänd som IVD. Ska bli kul!

 

Nej det var väl allt för en stund! Kom ihåg att ta hand om era goda bakterier! :D

 

 

 

Dagens bakterie får bli en väldigt slemmig Enterobact :) visst ser den ut som att den har ögon? :)

 

Tjoho alla! Ja det händer mycket nu på jobbet, som sagt så har vi ju fått en provsättningsrobot från Kiestra och vi håller på för fullt att validera den. Går sådär, ena dagen flyter allt på strålande och andra dagen fungerar ingenting... Suck när det går som det sistnämnda. Igår var en sådan dag så när det är en timme kvar på arbetsdagen och maskinen enbart har hunnit sätta nio urinprover så får man ju ta till lite drastiska åtgärder. Det blev att sätta alla urinprover förhand. Och ni som jobbar på ett mikrobiologiskt laboratorium vet ju att urinproverna brukar ju vara störst volymmässigt sett. Så det var ju iallafall över 50 prover. Så det var bara att börja märka upp plattor, sätta proverna samt pricka resistensplattorna och detta hann vi med på en timme pga fantastiskt samarbetsvilja. Så härligt och se när alla hjälps åt vid sådana situationer. :) Och det mest otroliga var att allt stämde tillslut, trots förvirringen. Jaja men vi kämpar på med roboten ändå men nu kör vi bara urinproverna på den (för det är den validerad för) och hittils idag har allt fungerat grymt bra! :) Jag älskar den provsättningsroboten då!!!! <3

 

Ja annars så har vi storstäd på jobbet och sysslar med våra plattor dag ut och dag in. Och det är ju härligt med plattor!! :D Speciellt när det växer på dem :)

 

Ja där fick ni en kort uppdatering på vad som händer på vårat extremt städat lab! :)

Idag, den 15 april, är en mycket stor och festlig dag. Det är nämligen den internationella biomedicinska analytikerdagen idag!!! Denna dag är till för att bland annat synas för allmänheten då vi tråkigt nog är en ganska osynlig yrkesgrupp. Dock är vi viktiga för det (såklart!!). Det har firats på lite olika håll i Sverige, i bland annat Stockholm, Göteborg och Karlstad. Själv har jag firat dagen med att tvinga sjukanmäla mig för första gången i mitt 24-åriga liv, men alla sätt är ju bra förutom de dåliga har ja hört ;) 

 

Så grattis till mig själv och alla andra fantastiska Biomedicinska analytiker! Vi är bäst! :D

Tjoho alla glada därute!! Hoppas eran helg har varit bra, det har iallafall min varit eftersom jag har jobbat denna helg och det innebär ju att ja får ännu mer tid att umgås med mina älskade vänner bakterierna (ja jag vet att det var väl lite väl överhurtigt av mig ;)) Och till alla er där ute som undrar, JA vi biomedicinska analytiker jobbar helg och det kan kännas lite småsurt emellanåt (speciellt om man nu skulle jobba julen) men annars tycker jag det är skönt faktiskt. Man kommer upp i tid och så jobbar man fram till ett-två på dagen och sen så har man hela dagen till att göra något annat. Annars kan man ju bli en BMA som jobbar på patologen de jobbar inte på helgerna (det är för att de inte är lika viktiga som oss ;) haha nej skämt åsido men lite rivalitet måste vi ju ha mellan avdelningarna eller? ;))

 

Ja på helgen är det ju mitt ansvar att ta hand om blodavdelningen och det var en helg med lagomt mycket larm, 7 st igår och 10 st idag. Mest växte dessa bedrövliga koagulasnegativa stafylokockerna som enbart kunde ses i en flaska. Och nu kanske ni undrar varför jag tycker de är bedrövliga, jo det är för att det är en provtagningsförorening från huden och inte någon bakterie som lever livet i blodet. Nej så tråkigt, man vill ju ha lite mer farliga patogena saker som växer i blodet (ja jag vet att det inte är bra för patienten men som mig för BMA är det guld med spännande och farliga bakterier, och ja Brucellan har ja ju redan känt på... Slipper dock gärna den nästa gång!) Men denna helg hittade jag några pneumokocker så jag får väl känna mig nöjd. Ja just det jag hitta en ESBL-producerande E. coli med, den får jag ju inte glömma!! Lite intressant var att det växte en ESBL E. coli i ena flaskan och en vanlig E. coli i den andra flaskan, varför just detta är intressant är för att vi på labbet diskuterar hur vi ofta överarbetar blododlingarna just och det kostar ju i sin tur stora pengar. Men om jag inte hade överarbetat detta prov kanske jag aldrig hade hittat den ESBL-producerande E. colin så hur långt ska man spara in?? Men ja det är ju den ständiga frågan, tyvärr ska ju allt handla om pengar!!

 

Men som tur är väntas en ny jobbvecka snart så jag får träffa min fantastiska vänner igen ;) Dessutom är det ju utbildning för provsättningsroboten på tis - spännande!!

Tjoho alla bakteriefreaks därute!! Tänkte ger er en kort information om vad som händer på vårt lab. Jo som jag har sagt så har våran provsättningsrobot kommit så nästa vecka så väntas utbildning på denna sak och den ges dessutom på engelska!! Få se hur det går med den utbildningen! ;) En ny MALDI-TOF ska vi dessutom få utbytt mot den gamla så tråkigt nog måste en ny validering göras av den! Suck på det men vad ska man göra... 

 

Sen vill jag berätta om en väldigt spännande bakterie som jag har stött på idag!! Den är väl kanske inte så rolig att ha (inte ett dugg faktiskt) men det är väldigt fascinerade att en bakterie kan få sådana resistensmekanismer. Denna bakterie var en Pseudomonas aeruginosa och den var hur resistent som helst - den var resistent mot ciprofloxacin, tacozin, ceftazidime, imipenem, MEROPENEM och enbart känslig för tobramycin. Och varför har ja gjort meropenem med stora bokstäver kanske ni undrar, jo det är för att meropenem brukar alltid vara känsligt, ALLTID!! Och som inte de vore nog så har denna patient även en MRSA. Detta tyder på att denna patient blivit behandlad med antibiotika, MYCKET antibiotika. Och det är ju inte bra för det är just då som bakterierna blir resistenta.

 

Ja det var allt som ja hade tänkt säga idag! Tjoho så länge!