De på jobbet tycker jag bygger instabila högar...
Med näsan i fokus!
Hejsan alla bakteriefreaks därute! Hoppas att ni alla har det bra i höstrusket! Ja idag som de flesta vardagar så har jag ju jobbat med mina älskade bakterier och idag så hängde jag bland bakt-proverna, det vill säga sårproverna. Där växer det ju mestadels Staphylococcus men även andra grampositiva och gramnegativa godingar kan hittas. Men det var ju inte riktigt som en vanlig dag idag. I några veckor framöver besöks laboratoriet av BMA-studenter och det är ju alltid trevligt. Så tänkte berätta en liten episod från en händelse idag när jag skulle berätta om olika bakteriers kolonimorfologi och doft (ja, vi BMA som jobbar på mikrobiologen LUKTAR på bakterier. Näsan är ju ett jätteviktigt redskap i vårat jobb!! Med näsan kan vi diagnotisera alfastreptokocker av millerigruppen, olika staffar med mera - vi är grymma helt enkelt! :)) Jag förklarade att Stafylokocker är vita till färgen vilket studenten inte riktigt kunde hålla med om. Hon tyckte snarare att de var gråa. Sen när jag tyckte att jag hittade Staphylococcus lugdenensis i ett patientprov med hjälp av doften då jag tycker att de luktar klor och simbassäng så kunde hon inte heller hålla med om det. Jaja på ingen bakterie tycker vi lika tänkte jag men en Pseudomonas aeruginosa måste hon ju ändå tycka att de kommer att lukta smultron. Men ack så fel jag har. Hon tycker att det luktar.... Bränt. Haha första gången jag hör det om en Pseudomonas iallafall. Och en annan kollega till mig tycker den snarare doftar som en sommaräng. Det är verkligen kul att vi alla har olika associationer! :) Men jag tyckte verkligen det var kul när jag hörde att en tyckte att Proteus lukta choklad. Den bakterie som stinker så mycket liksom! ;) Eller när en sa att E. colin dofta syrén...
Vad tycker ni att olika bakterier luktar som?
Woho vilka upptäckter! :)
Asså seriöst detta är bara för coolt!!! :) Jag, Stephanie Holmqvist, har HITTAT två nya bakterierarter. Dessa två hittades i urinprover, jag skickade dem till CCUG för typning och så får jag svaret tillbaka att det är två helt nya arter (som verkar vara släkt med Klebsiella och Raoultella)!! :) Shit dessa arter borde helt klart döpas efter mig. Så himla coolt asså, det är ju värsta drömmen ju!!! :) :D :)
Stephylococcus - värsta kändisbloggen ju!
Wohooooooooooooooooooo kolla vilken spännande läsning som fanns i Laboratoriet som kom ut igår ;) Så därför vill jag passa på att hälsa nya samt gamla läsare välkomna till min bakterieblogg. Där bakterier tas upp på ett lättsamt men ändå faktagivande sätt! Ja som sagt, välkomna! :)
!Dagens bakterie
Dagens bakterie får bli en katalasnegativ, grampositiv kock som hade en väldigt fin hemolys på ST-plattan. En sådan fin hemolys som enbart våra fina vänner betastreptokockerna kan ha! Självklart agglutinerades detta isolat som om den vore just en betastreptokock, det vill säga i A, C och G. Denna lilla filur agglutinerade dock i både C och G. Kan det då vara en alfastreptokock undrar vi, de brukar ju kunna slå i båda nämligen. Och kolonierna på plattan, njaaa de såg ju inte ut som betastreptokocker riktigt - de var alldeles för små såg snarare ut som pin points. Körde den ju såklart på våran älskade MALDI. Själv gick jag och fikade medan MALDI:n jobba på och när ja hade fikat klart så var svaret klart! Så bra ju!! Vad svarade den då? Jo att det var en Gemella haemolysans. Denna bakterie har jag aldrig hört talas om så jag och en kollega kolla upp detta. Denna gosing finns normalt i människans svalg och övre luftvägar. Den är lågvirulent och orskar ofta enbart sjukdom hos immunsuppressiva människor. Men nu till de viktigaste; hur ser dess kolonimorfologi ut? Jo de bildar små kolonier på blodagar och vissa stammar av G. haemolysans ger upphov till betahemolys på blodagarplattor som betastreptokockerna! Så det stämde ju väldigt bra med vårat isolat eller vad säger ni? 
;) Denna bakterie svarades inte ut eftersom den hittades i ett svalgprov, där den normalt ska finnas! Alla bakterier är inte farliga - komihåg det! :)
;) Denna bakterie svarades inte ut eftersom den hittades i ett svalgprov, där den normalt ska finnas! Alla bakterier är inte farliga - komihåg det! :)Dagens bakterie
Ja då var det dags igen för dagens bakterie. Dagens bakterie får bli en bakterie som enbart lyckades växa fram på chokladplattan. Provet som bakterien hittades i var från ett öra och dess kolonier var cirka 1-2 mm efter 48 h och dess färg vad grå. En Haemophilus tänkte jag och gjorde de plattor som behövdes för att verifiera och typbestämma just Haemophilus, dvs använda tre stycken plattor där den ena innehåller faktor V, den andra faktor X och den tredje innehåller båda faktorerna. Så idag när jag skulle läsa av dessa plattor så såg jag att de växte på V- och XV-plattan. Alltså så skulle det inte vara någon vanlig H. influenzae utan en H. parainfluenzae om man enbart kollar till hur bakterien växer på typningsplattorna. Dock så ska ju denna typ av Haemophilus växa på blodplattan också och ge upphov till hemolys där och detta stämde inte riktigt med det isolat som jag hade hittat. Tänkte en stund svara ut bakterien som Haemophilus sp men eftersom jag inte riktigt visste hur "viktigt" det var för läkaren att få den typad så tänkte jag att det kanske är lika bra att fortsätta typa den. Och vad passar då inte bättre än att använda sin älskade MALDI-TOF???!! :) Satte provet och några minuter senare (jaaaa visst är den snabb!! :)) så gav den mig svaret Eikenella corrodens. Hmmm, en bakterie som jag inte känner till så bra så det var bara att sätta sig och läsa lite på bakterien. Eikenella corrodens är en kräsen gramnegativ bakterie som är fakultativt anaerob (hittills stämmer det ju rätt så bra, eller vad säger ni?) Dock förbättras tillväxten avsevärt då den odlas i 3-10% koldioxidmiljö! (Så bra att vi gjorde just det ;)). Ett annat kännetecken för bakterien är att den kräver att agarn innehåller hemin om den odlas aerobt men om den odlas ananerobt så behöver agarn inte denna tillsatts! Kolonierna ska vara små och ha en grå nyans och den ger även upphov till en grön zon runt själva kolonin. De är oxidaspositiv men negativ i katalas, indol och ureas.
Vart hittar man då denna sötnos normalt? Jo i människors munnar och de övre luftvägarna! Det är tydligen ett ovanligt fynd vid infektioner (dock vanligare hos immunsuppressiva) och hittas dem görs det normalt vid blandinfektioner och då framförallt med streptokocker (som i detta fall!). Denna bakterie ses ofta hos patienter med cancer i huvud- och nackregionen men även hos personer som har blivit bitna av någon annan människa! Ses även hos personer som missbrukar då de tydligen brukar slicka på sina nålar (varför de nu vill göra det, inget som jag rekommenderar...) Brukar inte ge upphov till allvarliga infektioner men om de lyckas så brukar de tydligen lukta illa om infektionen (de härmar de coola anaeroberna!)
Om man nu skulle få problem med en sån här corre så kan man behandla dem med penicilliner (ej smalspektra pc), cefalosporiner och tetracykliner, dock är den resistent för makroliderna. Men har även kunnat påvisa in vitro att den är känslig för fluorokinoloner som exempelvis ciprofloxacin men det finns inga tillräckliga bevis på att detta skulle stämma in vivo.
Så vad tror ni jag svarade ut den tillslut som då? Jo som en Eikenella corrodens! :)
Att dö eller att inte dö?
Tjoho! Jo jag avslutade ju det förra inlägget när det blev som mest spännande känner jag. Dock lova jag er en fortsättning och den kommer nu! :) Sammanfattningsvis kan jag säga att det förra inlägget handla om varför bakterier är patogena och om deras virulensfaktorer. Då nämnde jag olika toxiner och enzymer bakterien utnyttjade för att bli patogent. Men det finns ett annat sätt för de små bakterierna att bli patogena, de kan nämligen undgå fagocytos - dvs undgå att bli uppätna av celler från värdens immunförsvar. Detta är en viktig virulensfaktor för bakterien eftersom ju längre tid de är i kroppen desto större och allvarligare blir infektionen/skadan. Kroppen försöker ju hindra detta genom att frisläppa celler, exempelvis makrofager, som tar död på bakterien. Men det finns ett antal sätt för bakterien att undkomma detta och det är med hjälp av kapslar och antifagosytiska kemikalier.
Många patogena bakterier använder sig utav kapslar då dessa består av komponeneter som normalt finns i kroppen som exempelvis polysackarider. Detta resulterar i att kroppens immunförsvar tycker att bakterien ska finnas i kroppen och på så sätt sätts inget immunsvar in. Bakterien överlever! Ja ni ser ju hur smarta dessa små filurer är! :)
Antifagosytiska kemikalier används av exempelvis Neisseria gonorrhea och dessa förhindrar en sammanslagning av lysosomer med fagosytiska vesiklar vilket möjliggör för bakterien att överleva inne i fagocyten. Ett annat exempel är Streptococcus pyogenes (även kallad Grupp A streptokock, mördarbakterien etc) som producerar ett protein på dess cellvägg och fimbriea som kallas protein M. Protein M kan förhindra fagocytos och ökar därför bakteriens virulens! Andra bakterier producerar leukocidiner som förstör fagocyterande celler.
Så det var allt som ja hade tänkt säga om dess virulensfaktorer (för ett tag iaf - man vet ju aldrig vad man känner för att skriva i framtiden ;)) Så hoppas att ni har blivit lite visare om just detta! :)
Virriga virulenta mikroorganismer
Tjoho alla trevliga bakteriefreaks därute! Hoppas ni har det bra i höstrusket! :) Ja nu börjar vi närma oss vintertider och då börjar ju snart olika sjukdomar blossa upp. Dock orsakas inte alla dessa sjukdomar av våra älskade bakterier utan det finns ju även det som orsakas av de dumma viruserna! Men alla bakterier är ju inte goda och idag hade jag tänkt gå in på varför bakterierna blir dumma, alltså vad det är som gör dem farliga. En mikroorganisms förmåga att orsaka sjukdom kallas för patogenicitet. Detta ska inte blandas ihop med mikroorganismens virulensfaktor som beskriver graden av patogenicitet. De finns de bakterier som har en hög virulensfaktor - dvs de orsakar alltid sjukdom - och det finns bakterier som är lågvirulenta och orsakar enbart infektioner hos immunsuppressiva personer eller om bakterien finns i ett stort antal.
Bakterierna har ett antal egenskaper som gör dem patogena. Dessa egenskaper gör det möjligt för bakterien att ta sig in i en människa och där fästa sig till en värdcell. Därefter kan den börja ta upp näring från den omgivande miljön och undgå att bli upptäckt av immunförsvaret. Det är dessa egenskaper som kallas för virulensfaktorer. Patogena bakterier har en eller flera av dessa virulensfaktorer medans de icke-virulenta bakterierna saknar dem. Några exempel på virulensfaktorer som olika bakterier nyttjar är: Extracellulära enzymer, toxiner (exotoxiner och endotoxiner), kapslar, biofilmer samt adhesionsfaktorer.
Extracelluära enzymer utsöndras av många patogener och detta gör det möjligt för bakterien att förstöra celler i värden vilket leder till att bakterien kan spridas ut till vävnader. Några exempel på extracellulära enzymer är Hyaluronidas och kollagenas som bryter ned specifika molekyler. Detta gör det möjligt för bakterien att invardera vävnader som ligger längre ned. Hyaluronidaset bryter ned hyaluronsyra som fungerar som ett "lim" som håller samman djurceller medan kollagenaset bryter ned proteinet kollagen som bygger upp kroppen. Ett annat enzym som vissa bakterier använder sig utav är koagulas som koagulerar blodproteiner vilket leder till ett perfekt gömställe för bakterien. S. aureus är ett exempel på en bakterie som använder sig utav koagulas.
En annan virulensfaktor är toxinerna som antingen skadar vävnaderna eller triggar värdens immunsvar vilket i sin tur leder till vävnadsskada. Det finns två typer av toxiner - exotoxiner och endotoxiner. Exotoxiner förstör antingen värdcellen eller så stör den dess metabilosm. Det finns tre typer av exotoxiner och det är: Cytotoxiner som antingen dödar värdcellen eller påverkar dess funktion, neurotoxiner som stör nervfunktionen och enterotoxiner som påverkar cellinjen i mag-tarmkanelen. Dessa virulensfaktorer nyttjas flitigt av våran älskade sporbildande bakterie Clostridium som orsakar gangrän, botulism och stelkramp!
Endotoxiner däremot kan vara ett dödligt toxin för värden och detta frisläpps från den gramnegativa bakteriens cellvägg när de är döda eller döende. Endotoxiner stimulerar kroppen att frisläppa ämnen som orsakar feber, inflammation, chock och blodkoagulering. Det är när toxinet drabbar kroppen systemiskt som det kan bli dödlig utgång.
Sen finns det även andra virulensfaktorer som hjälper bakterien att undkomma fagocytos. Men den historien tar vi en annan dag :)
